Jan - Data Analyst PYTHON

Ref : 190618D001
Photo de Jan, Data Analyst PYTHON
Compétences
PERL
JAVASCRIPT
MYSQL
PYTHON
BASH
R
Expériences professionnelles

  • Background

    As a scientific engineer, my main interests has been genetics and infogenomics. More info is available at
    ********

    Bioinformatics engineer
    12/2018- UR AgroImpact
    INRA – Monsgenomes comparisons, enrichment analysis python, R, freewares ( … ) INRA (Versailles),
    ICV (Lille)

    12/2015-11/2018
    CRRBM – UPJV
    Amiens de novo assembly, DE analysis python, R, freewares (abyss, transabyss, InterProScan, ..)
    UTC (Compiègne), GIE LINEA

    06/2015-11/2015
    IBPC – CNRS
    Paris de novo assembly bash, python, R, freewares (abyss, PacBio softs, ..)

    09/2012-05/2015
    IBENS – CNRS
    Paris DE analysis, genomes comparisons bash, python, R, freewares (bedtools, Jbrowse, ..) AgroParisTech

    09/2011-08/2012
    MIS lab. – UPJV
    Amiens de novo assembly bash, freewares (edena, abyss, ..)

    Molecular biology engineer
    02/1993-08/2011
    IJPB – INRA
    Versailles molecular cloning, PCR, etc.
    Single-molecule PCR, long range PCR, ...
    University of Birmingham

Études et formations

  • Skills

    I got an academic education, before and all along my career. My assignments allowed me to deal
    with increasing amounts of biological data. Then, I got the the chance to develop strong skills in
    IT and turned to bioinformatics and data analysis in general.
    ●Technical
    ● Informatics / computer science
    ●System setup and maintenance : Linux [4], Windows [1], MacOS [1].
    ●Programming langages / APIs : Bash [4], Python[4], R [4], PERL [2], PHP [2], JavaScript
    [2], C [2], Java [2].
    ●Data storage and retrieval [3] : SQL, XML, JSON, HDF.
    ●Web managment : Apache [3], Tomcat [2].
    ●Statistics
    ●Descriptive statistics & statistical inference [3].
    ●Multivariate statistics [3], GLM [2], unsupervised learning [2].
    ●Relationnal
    ●Team playing [4], autonomy [4], initiative [4], organisation [4].
    ●Team managment [2].
    1 : basic notions … 5 : expert knowledge

    Education
    ● 2015/06 Master degree level in bioinformatics, University of Rouen

    ● 2010/06 PhD in biology, University Paris-XI.

    ● Juillet 1998 Master degree in cell molecular physiology, University Paris-XI.

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