Formation
Décembre 2004 Doctorat en Informatique mention Très Honorable à l’Université d’Aix-Marseille II, dans le Laboratoire de Chimie Bactérienne de Marseille (CNRS) et à l’Institut de Mathématiques de Luminy.
Juillet 2001 DEA d’Informatique mention B `a l’Université d’Aix-Marseille I
Juillet 2000 Maîtrise d’Informatique mention AB `a l’Université d’Aix-Marseille I.
Juillet 1999 Licence d’Informatique mention AB `a l’Université d’Aix-Marseille I.
Langues Étrangères
Anglais : Maîtrise de l’anglais scientifique et niveau correct en anglais parlé.
Allemand : Niveau correct en allemand écrit (1ère langue – filière Allemand bilingue au collège et lycée).
Compétences
Systèmes : Linux, Unix, Windows
Langages : Standard : C, C++, Perl, Java, SQL
Internet : PHP/MySQL, HTML, Javascript, CSS, XML, XSLT, JSP
Interfaces : GTK+, QT, Flash actionscript
Divers : R (analyse statistique), script shell, Awk, Visual Basic
Modélisation : UML
Outils informatique : LATEX, Gimp, Dia, Eclipse, Pack Office
Connaissances mathématiques : Analyse typologique, Problèmes de satisfaction de contraintes (CSP),
Traitement du signal, Traitement des graphes
Bioinformatique : Outils d’alignement de séquences (Clustal, Blast), Bases AceDB, Phylogénie (TreeDyn, paquetage Phylip)
Relecture technique : Correction d'ouvrages informatiques pour le compte des éditions Eyrolles.
Août 2008 à nos jours : INFO2DEV - Gérant
Conseil, Formation et Développement en informatique.
Responsable d’enseignements à l’Université de Provence et à l’Université Paul Cézanne.
Mai 2008 à Août 2008 : Index Education - Ingénieur Logiciel
Développement d'un module LDAP en Delphi, refactoring de code (procédural vers objet).
Préparation de la certification Microsoft des produits de l'entreprise.
Sept. 2006 à Mai 2008 : Business Product Software (Buyingpack) - Ingénieur R&D
Développement d’un portail achat simplifié (technologies PHP, Ajax, TMX) –
Elaboration du cahier des charges, Choix technologiques, et
Encadrement de l’équipe de développement.
- Documentation de l’existant et des nouvelles technologies - Veille technologique
- Responsable du recrutement et de la formation des nouveaux personnels R&D
Fév. 2005 à Sept. 2006 : Centre de Mathématiques et d’Informatique, Université de Provence - Aix-Marseille I
et Laboratoire de Chimie Bactérienne (CNRS) - Enseignant
- Responsable de l’enseignement ”Programmation en PHP” (Cours TD et TP : PHP/MySQL) en Licence Professionnelle NTI (Nouvelles Technologies Informatique) et en Mastère Informatique 1ère année.
- Responsable de l’enseignement ”Outils de l’internet” (Cours, TD et TP : HTML, CSS, JavaScript, PHP/MySQL, XML, XSLT) en Licence Pro. NTI et en Mastère Info. 1ère année.
Encadrement de projets
- Logiciel de gestion de notes, Etude comparative de génomes
Responsabilités au sein du Laboratoire de Chimie Bactérienne
- Participation au développement et maintenance du site Internet et Intranet du Laboratoire (logiciel de gestion des commandes de fournitures, différents outils bio-informatiques, ...)
Développement d’un logiciel d’analyse de signaux biologiques (C/GTK)
- Quantification de l’intensité d’un signal respiratoire parasité par le rythme cardiaque.
Application de transformées de Fourier, Spectres de densité d’énergie, Ondelettes.
Développement d’un logiciel de création de Base de Données (Perl/PHP/MySQL/HTML/Javascript)
- Création d'une base de données biologiques d'après les données du site du NCBI
Oct. 2001 à Sept. 2004 : Laboratoire de Chimie Bactérienne (CNRS) et Institut de Mathématiques de Luminy - Classification de systèmes biologiques
Recherche de zones denses, c’est-à-dire de classes qui possèdent un fort pourcentage d’arêtes internes, au sein d’un graphe de protéines.
- Résultats : une nouvelle méthode basée sur un calcul de densité locale et validée sur un ensemble de graphes générés aléatoirement. Ce travail a donné lieu à une publication et à une communication lors d’une conférence internationale.
Reconstruction de systèmes biologiques par Fouille de Données
- Regroupement de gènes fonctionnels sur la base de critères évolutifs.
- Résultats : une nouvelle méthode validée sur des données aléatoires et fournissant un taux d’erreur inférieur à 1%. Ce travail a donné lieu à une publication.
Etude évolutive de génomes bactériens
- Recherche de gènes conservés au cours de l’évolution dans différents génomes bactériens.
- Résultats : une nouvelle méthode inspirée des Problèmes de Satisfaction de Contraintes (CSP). Développement d’un logiciel accessible en ligne (CGI Perl). Ce travail a donné lieu à trois publications et à trois communications orales.
Oct. 2001 à Sept. 2004 : Université Paul Cézanne – Aix-Marseille III - Enseignant
- Enseignement de la ”Théorie des Langages” (TD : Langages, Grammaires, Automates, Machines de Turing) en DEUG MIAS 2ème année.
- Enseignement de la ”Programmation en C” (TD et TP : Structures, Pointeurs, Architecture de programmation) : création d’un jeu d’échecs en C/GTK+ en DEUG MIAS 2ème année.
- Enseignement de la ”Programmation en C” (TD : Bases de la programmation, Variables, Tests conditionnels, Boucles) en DEUG MIAS 1ère année.
- Enseignement de la ”Programmation en C” (TD : Listes et Pointeurs, Correspondances entre Pascal et C) en DEUG MIAS 1ère année.
Oct. 2000 à Sept. 2001 : Université de Provence – Aix-Marseille I - Enseignant
- Enseignement des ”Scripts Shell sous UNIX” en DEUG MIAS 1ère année.
